Fartyget hade cirka 150 passagerare och besättning från 23 länder ombord när Världshälsoorganisationen (WHO) först informerades om hantavirusutbrottet i början av maj.
Tjugofem besättningsmedlemmar och två räddningspersonal var fortfarande ombord när fartyget anlände till Rotterdam på måndagen.
Enligt lokala medier har holländska myndigheter förberett karantänåtgärder för en del av besättningen.
Långa väntetider efter virusutbrott
Efter att flera personer insjuknat och tre dog, fick fartyget stå stilla utanför Kap Verdes kust i flera dagar eftersom staten vägrade låta dem gå i land.
Efter att ha evakuerats på Kanarieöarna styrde fartyget mot Rotterdam med en begränsad besättning ombord.
WHO: Jämför inte med det nya coronaviruset
WHO har betonat att situationen inte kan jämföras med coronaviruset och inte är en pandemi. Samtidigt förväntas fler fall upptäckas, eftersom hantavirus har en inkubationstid på upp till sex veckor.
Den 15 maj har totalt 10 fall rapporterats, inklusive tre dödsfall, varav åtta är bekräftade och två troliga, enligt WHO. Ytterligare ett misstänkt fall i Kanada utreds.
Enligt WHO anses detta virus utgöra en låg risk för den globala folkhälsan.
